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BioXL禽流感病毒H1- H15通用型PCR檢測(cè)試劑盒說明書

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2009-03-04
核心提示:【試劑盒組成】 25 管 擴(kuò)增反應(yīng)試劑球 (Reagent Sphere; 4℃ 保存) 2 x 520 l AIV 擴(kuò)增反應(yīng)試劑球溶液 (Sphere Diluent; -20℃ 保存) 2 x 25 l 陽性對(duì)照 (Positive control; -20℃ 保存) 【保存條件】 試劑球需置干燥劑中保存在4℃,已融解的試劑球則需保存在零下20℃


【試劑盒組成】
25 管 擴(kuò)增反應(yīng)試劑球 (Reagent Sphere; 4℃ 保存)
2 x 520 μl AIV 擴(kuò)增反應(yīng)試劑球溶液 (Sphere Diluent; -20℃ 保存)
2 x 25 μl 陽性對(duì)照 (Positive control; -20℃ 保存)

【保存條件】
試劑球需置干燥劑中保存在4℃,已融解的試劑球則需保存在零下20℃。其他試劑亦需保存在零下20℃。使用前在冰上溶解各試劑并充分混合,不要旋渦振蕩含酶的擴(kuò)增反應(yīng)試劑。

【操作程序】
1 樣本采集、存放及運(yùn)輸
1.1 樣本采集:
所用取樣器材必須經(jīng)高壓或干熱滅菌。
若樣品為活禽,建議取咽喉拭子和泄殖腔拭子:取咽喉拭子時(shí)將拭子深入喉頭口及上顎裂來回刮幾次取咽喉分泌液,取泄殖腔拭子時(shí)將拭子深入瀉殖腔轉(zhuǎn)一圈沾取糞便。然后將拭子一起放入盛有2ml PBS(含抗菌素)的試管,充分洗滌拭子,然后在管壁擠干液體,轉(zhuǎn)入無菌離心管中備用。
若樣品為新鮮肌肉或臟器,取待檢樣品2g于已洗凈、滅菌并烘干的研缽中充分研磨,加10ml PBS混勻,取上清轉(zhuǎn)入無菌離心管中備用。為使樣品的代表性更強(qiáng),也可取50克肉樣,加入50ml無菌的PBS液,用Bagmixer均質(zhì)器處理后,取上清備用。
若樣品為血清、血漿或冷凍組織滲出液,則直接取用。
1.2 存放:
分離后的樣本在2℃—8℃條件下保存應(yīng)不超過24hr; -70℃以下可長期保存,但應(yīng)避免反復(fù)凍融(最多凍融3次)。
1.3 運(yùn)輸:
采用冰壺或泡沫箱加冰密封進(jìn)行運(yùn)輸。
2 樣本處理:
2.1  取n個(gè)1.5ml滅菌離心管(n = 樣本數(shù)+ 1管陰性對(duì)照+ 1管陽性對(duì)照),作好標(biāo)記。
2.2  首先加入600ul裂解液(裂解液即提取液,有很強(qiáng)的腐蝕性,切勿沾到皮膚或衣物,否則立即用大量清水沖洗并擦干),然后分別加入待測(cè)樣本、陰性對(duì)照、陽性對(duì)照各200ul(一份樣本換用一個(gè)吸頭);再加入200ul氯仿,混勻器上振蕩混勻5sec(不宜過于強(qiáng)烈,以免產(chǎn)生乳化層,也可用手顛倒混勻)。
2.3 于12,000g離心15min(如有條件,于4℃進(jìn)行離心)。
2.4  取與步驟2.1.1中相同數(shù)量的1.5ml滅菌離心管,加入400ul異丙醇(-20℃預(yù)冷),作好標(biāo)記。吸取步驟2.1.3各管中的上清液相轉(zhuǎn)移至相應(yīng)的管中(上清液應(yīng)至少吸取500ul,注意不要吸出中間層,該層富含DNA和蛋白質(zhì)),顛倒混勻。
2.5  12,000g離心15min,(注意固定離心管方向,即將離心管開口朝離心機(jī)轉(zhuǎn)軸方向放置)。輕輕倒去上清,倒置于吸水紙上,沾干液體(不同樣品應(yīng)在吸水紙不同地方沾干);加入600ul 75%乙醇(-20℃預(yù)冷),顛倒洗滌。
2.6  12,000g離心10min,(注意固定離心管方向,即將離心管開口朝離心機(jī)轉(zhuǎn)軸方向放置)。輕輕倒去上清,倒置于吸水紙上,盡量沾干液體(不同樣品應(yīng)在吸水紙不同地方沾干)。
2.7  4,000g離心10sec(注意固定離心管方向,即將離心管開口朝離心機(jī)轉(zhuǎn)軸方向放置)將管壁上的殘余液體甩到管底部,用微量加樣器盡量將其吸干(一份樣本換用一個(gè)吸頭,注意吸頭不要碰到有沉淀一面),室溫干燥5-10min(不宜過于干燥,以免RNA不溶)。
2.8  加入11ul DEPC水,輕輕混勻,溶解管壁上的RNA,2,000g離心5sec,冰上保存?zhèn)溆茫ㄗ⒁猓捍藭r(shí)的RNA最易受RNA酶降解,請(qǐng)?jiān)?小時(shí)內(nèi)進(jìn)行PCR擴(kuò)增)。

3 擴(kuò)增反應(yīng)試劑的準(zhǔn)備:
3.1 計(jì)算所需的反應(yīng)數(shù)量 (n)
3.2 需要溶解的試劑球 = 0.5 x n
3.3 每個(gè)試劑球需要 40 μl 試劑球溶液

3.4 在冰上溶解試劑,并輕輕扣擊充分混合 (不要旋渦振蕩含酶的試劑)

4 反應(yīng)的準(zhǔn)備
4.1 實(shí)驗(yàn)中除從樣本中獲得的RNA 模板外,我們還建議設(shè)置陽性和陰性(水)對(duì)照
4.2 按照下表準(zhǔn)備擴(kuò)增反應(yīng)試劑:
反應(yīng)組分--每個(gè)反應(yīng)體積
擴(kuò)增反應(yīng)試劑 20 μl
樣品RNA 5 μl
總體積 25 μl
注意:實(shí)驗(yàn)時(shí) RNA 應(yīng)放在冰上,陽性對(duì)照建議加5 μl 試劑盒提供的陽性對(duì)照。建議PCR 過程中檢測(cè)樣本設(shè)置重復(fù),以便得到可靠的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。為了驗(yàn)證陰性實(shí)驗(yàn)結(jié)果不是由于樣本中存有PCR 抑制物而導(dǎo)致PCR 呈陰性反應(yīng),我們建議在測(cè)試樣本中加1 μl 的陽性對(duì)照作為spiking 對(duì)照(spiking control),同時(shí)進(jìn)行PCR 反應(yīng)。
PCR 循環(huán):
1 個(gè)循環(huán)  42℃ 30 分鐘
95℃ 10 分鐘
40 個(gè)循環(huán) 95℃ 30 秒
53℃ 30 秒
72℃ 30 秒

5 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析
PCR 的產(chǎn)物需要通過瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。
產(chǎn)物長度 : 246 bp
Spiking 對(duì)照陰性的實(shí)驗(yàn)結(jié)果有幾個(gè)可能性: 樣本中不存在目的片段;樣本中目的片段的量低于檢測(cè)值;
【樣本中存有 PCR 抑制物】
試劑盒中設(shè)計(jì)spiking 對(duì)照 (spiking control) 是為了確定沒有發(fā)生PCR 抑制。如果樣本中加了陽性對(duì)照以后得出陰性結(jié)果,說明樣本中存在PCR 抑制物,那幺此次陰性的實(shí)驗(yàn)結(jié)果就不能作為正確的結(jié)果,需要重新開始樣本核酸的提取和PCR 擴(kuò)增。

備注:
對(duì)于禽流感檢測(cè)樣本的獲得和前處理,可以參照國家標(biāo)準(zhǔn)“高致病性禽流感診斷技術(shù)(GB/T 18936-2003)”推薦的方法進(jìn)行,具體為:
【病料的采集】死禽采集氣管、脾、肺、肝、腎和腦等組織樣品,進(jìn)行分別處理或者同時(shí)處理;活禽病料應(yīng)包括氣管或泄殖腔拭子,尤其以采集氣管拭子更好;小珍禽用拭子取樣易造成損傷,可采集新鮮新鮮糞便。

【病料的保存】病料應(yīng)放在含有抗菌素的pH值7.0~7.4的等滲磷酸鹽緩沖液(PBS)內(nèi)(無PBS可用25%~50%的甘油鹽水)。抗生素的選擇視當(dāng)?shù)厍闆r而定,組織和氣管拭子懸液中應(yīng)含有青霉素(2000IU/ml)、鏈霉素(2mg/ml)、慶大霉素(50µg/ml)和制霉菌素(1000IU/ml),但糞便和泄殖腔拭子所有的抗生素濃度應(yīng)提高5倍,加入抗生素后pH值應(yīng)調(diào)至7.0~7.4。在室溫放置1h~2h后樣品應(yīng)盡快處理,沒有條件的可在4℃存放幾天,也可于低溫條件下保存(-70℃貯存最好)。

【病料的處理】將棉拭子充分捻動(dòng)、擰干后棄去拭子;糞便、研碎的組織用含抗生素的pH值7.0~7.4的等滲PBS溶液配成10%~20%(g/ml)的懸液,樣品液經(jīng)1000r/min離心10min,取上清液作為實(shí)驗(yàn)材料。

【病料保存樣本保存和運(yùn)送的一般原則是什么】
一般性原則:采集和運(yùn)輸:
標(biāo)本采集用材料,如棉簽和拭子都應(yīng)一次性使用,所使用的抗腐劑和抗凝劑不應(yīng)對(duì)樣本和擴(kuò)增反應(yīng)有降解或抑制作用。
對(duì)于RNA樣本,要特別注意混入操作人員的毛發(fā)、表皮細(xì)胞和痰液。
對(duì)于DNA樣本的運(yùn)送:可在室溫下運(yùn)送,建議在8小時(shí)內(nèi)完成,對(duì)RNA,10分鐘內(nèi)的運(yùn)輸可在室溫進(jìn)行,超過此時(shí)間,必須加冰運(yùn)輸,既便低溫,一般亦不得超過4小時(shí)。
標(biāo)本的保存:對(duì)DNA:2℃-8℃可穩(wěn)定放置3天,RNA一律-20℃保存。
主要的擴(kuò)增反應(yīng)抑制物質(zhì):血樣中用于抗凝的肝素,可以枸櫞酸鈉或EDTA-K3替代;血紅蛋白、乳鐵蛋白
【口腔棉簽拭子和瀉殖腔樣品如何保存】
口腔棉簽拭子和瀉殖腔樣本一般不單獨(dú)保存,在取樣后,應(yīng)盡快將其放入含PBS緩沖液(有時(shí)要加入抗生素)的離心管充分捻動(dòng),擰干后立即進(jìn)行處理和使用,不立即使用時(shí),推薦-70℃低溫保存。如果暫時(shí)不處理,也可將拭子留于離心管中低溫保存。

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