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PCR反應擴增產(chǎn)物平端連接法

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2024-08-16  來源:上海撫生實業(yè)有限公司
核心提示:實驗原理:平頭連接是將制備好的平頭載體和補平或削平的PCR產(chǎn)物直接進行連接。載體可用EcoR V或Sma I切成平頭;PCR產(chǎn)物純化后,可

實驗原理:

平頭連接是將制備好的平頭載體和補平或削平的PCR產(chǎn)物直接進行連接。載體可用EcoR V或Sma I切成平頭;PCR產(chǎn)物純化后,可以在22℃用DNA聚合酶I作用30min(利用該酶所具有的3’→5’外切酶活性和5’→3’的聚合酶活性)。

如果要求不高,PCR產(chǎn)物也可不加處理。如果使用Stratagene公司的pfu DNA聚合酶或New England Biolabs公司的Vent DNA聚合酶,這兩種酶有5’→3’校對能力,擴增出來的PCR產(chǎn)物已經(jīng)是平頭,可以不作平端處理。平端連接的一個顯而易見的缺陷是連接效率低下,即使使用很高單位的連接酶,或在反應體系中加入PEG 8000,也只能很有限地提高效率。

通常情況下,PCR產(chǎn)物可直接與平端載體DNA進行連接,但其連接效率效低。因為Taq DNA聚合酶具有非模板依賴性末端轉移酶活性,能在兩6條 DNA鏈的3'末端加上一個多余的堿基,使合成的PCR產(chǎn)物成為3'突出一個堿基的DNA分子。

這種DNA分子的連接效率很低。由于PCR產(chǎn)物的效率通過較高,在采用大量T4 DNA連接酶并配以5-10u T4 RNA連接酶時,可顯著提高其連接效率。

對于較短PCR產(chǎn)物,用PUS19的HincⅡ位點進行克隆,以X-gal和IPTG篩選,?傻玫阶懔恐亟M子。另一種提高克隆效率的途徑是先用Klenow大片段或T4DNA聚合酶消去3'末端突出堿基將PCR產(chǎn)物變成平端DNA,然后再用平端連接法克隆PCR產(chǎn)物。

編輯:songjiajie2010

 
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