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首先，問題建立在錯誤的假設(shè)上。如果流動相沒了，泵的確會吸進(jìn)去一些空氣，但是并不會持續(xù)的讓空氣流經(jīng)整個系統(tǒng)。這是因?yàn)?/font>HPLC的泵是設(shè)計(jì)成專門用來吸取液體的，空氣一旦進(jìn)入，泵就會失去灌注（lose prime）并停止工作。當(dāng)然，在泵完全停止之前，一些氣泡可能會進(jìn)入柱子，但是這種情況不會一直持續(xù)下去。就算由于某種因素，柱子里面泵入了大量的空氣，損壞柱子可能性也不是很大。
那么如果真的遇上這種情況，該如何處理呢？
當(dāng)然是要把空氣從所有通道里排出來。不過在這之前最好把柱子取下來。首先換上新的徹底脫氣后的流動相，然后打開排氣閥進(jìn)行正常灌注 （prime the pump），對于有些型號的儀器，可能需要用注射器進(jìn)行手動灌注。接下來要設(shè)定一個較高的流速（比如10 mL/min）并運(yùn)行幾分鐘來徹底清除泵里面以及管道里面殘留的空氣。這一步完成之后將流速調(diào)至1mL/min 并關(guān)閉排氣閥，運(yùn)行直到徹底沒有氣泡排出。然后將流動相換成100%的甲醇或者乙腈并沖洗一會兒，這兩種有機(jī)溶劑的粘度相對較低有助于清除系統(tǒng)管道和柱子中的空氣。
第二步就是如何排出柱子中的空氣。將柱子進(jìn)口端連上，保留出口端不要接檢測器，可以接上一段管道并用燒杯或者廢液瓶收集排出來的流動相。啟動泵并逐步增大流速直到柱壓達(dá)到3000-4000 psi （高壓能夠?qū)馀輭嚎s回溶液并排出柱子），持續(xù)運(yùn)行10分鐘左右直到?jīng)]有氣泡從柱子的尾端排出。檢測器中可能也會有殘留的氣泡，但是很容易通過沖洗清除。
以上只是反相色譜柱排氣的程序。對于其他類型的色譜柱，溶劑要相應(yīng)的更換成兼容的。如果柱子不是硅基的，要特別注意柱子的最大允許柱壓。對于由于長期儲存而變干燥的色譜柱，也可以使用相同的方法使其恢復(fù)良好狀態(tài)。
不過，雖然空氣不會對色譜柱造成實(shí)質(zhì)性的傷害，但是泵在沒有流動相的狀態(tài)下長時間運(yùn)行可能會損壞密封墊。因?yàn)榱鲃酉噙�充當(dāng)了活塞和密封墊之間的潤滑劑，沒有了流動相的潤滑作用，密封墊就很容易磨損。所以一旦流動相用盡空氣進(jìn)入泵，除了排出空氣，還要特別注意檢漏。如果沒有觀察到明顯的泄露，要注意觀察泵在正常運(yùn)行下的柱壓是否正常和穩(wěn)定，如果柱壓沒有問題，就說明泵是正常的。如果觀察到柱壓偏低或者波動，說明密封墊可能磨損，需要更換密封墊。
