龙眼是一种对水肥条件要求比较严格，高产量和高收益的果树品种，要求的立地条件和肥水条件比荔枝要严格得多。龙眼的产量因肥水条件的差异而变化很大。科学施肥是提高山地龙眼种植效益的关键。
龙眼结果期既是养分的积累又是养分的消耗最多的时期。由于果品的消耗，在大年时占当年施肥量的２／３，小年时占当年施肥量的１／３左右。果实生长发育期大部分的光合产物转移到果实上，根与果争夺有机养分处于劣势，根与梢交替生长的特点并没有突出。在果实膨大期，龙眼根系在吸肥时具有特别强的能力。因此，根据龙眼结果树的生长需求，保证各种矿物元素源源不断地供应根系，结合适当的根外追肥，对提高产量和改善品质，加速采果后树势的恢复，都是十分必要的。
龙眼结果树的施肥原则：见花施肥，以产定量；以有机质根际施肥为主，化学肥料配合和根外追肥为辅；有机质肥早施深施，化学肥淋施或撒施；早施攻梢肥，增施磷钾肥和微肥。
龙眼结果树的科学施肥方法：是需肥量和施用效益是科学施肥考虑的前提，按需施肥和平稳供肥是提高肥料利用率和获取最大经济效益的途径。不同果园由于所处的立地条件，土质肥瘦，树势强弱，叶绿层厚薄，树龄和挂果多少而千差万别，因此施肥上不能一概而论，更没有统一的标准。但就一般而言，每挂果５０公斤，当年需肥量相当于有效养分纯氮１—１·２公斤，磷０·２—０·３公斤，氧化钾０·８—１公斤，氮、磷、钾比例为１：０·３—０·５：０·８—１。在生产实际中，由于肥料的总类和利用率的不同，其施用数量还有很大的差别。就茂名地区山地龙眼来说，每产５０公斤果，当年应施麸类４—７公斤，鸡粪１０—１５公斤，尿素３—４公斤，过磷酸钙２—３公斤，氯化钾３—３·５公斤，肥料成本约在２５—３８元／株左右。这样，当年的产量和采果后秋梢的培养就有了较大的保证，达到增加施肥效益的目的。
见花施肥、以产定量在东南亚各国以及台湾产区已普遍采用，取得了明显的效果。此期施肥以有机质肥为主，一般分两次施用，占全年施肥量的６０％—７０％以上。
第一次在见红点到花序抽生期施用，应在去冬翻土控梢期间，有计划地先开２—３个４０—８０厘米、深３０厘米的环状沟，把有机肥料配适量化肥，再加上１００克荔枝、龙眼肥料专用添加剂与土混匀后回坑；第二次一般在５月中旬前后，在树冠底下与原位置错开，开３—４条放射状的坑与有机质肥配合磷钾肥混土施下；第三次施肥应在收果前的１５—２０天即７月上中旬施用，这次以速效的化肥加５０—１００克荔枝龙眼专用肥料添加剂，在树冠下开浅沟或雨天后撒施。此次肥料对满足果实发育需要，增加产量，采果后及时恢复树势，培养强壮的第一次秋梢具有十分重要的作用；第四次肥料应在第一次秋梢转绿后于９月中旬前后及时施下，此次肥应适当增加氮肥用量，干旱时要注意水肥配合，以促进根系生长和第二次秋梢于１０月中下旬及时抽出；最后一次肥可在１１月上旬施下，补施一次以钾肥为主的水肥，促进叶片及早老熟，促进花芽的生理分化。
施肥上要注意上半年以有机质肥为主，下半年攻梢肥以化学肥为主，少施或不施有机质肥料。因为有机质肥料在土壤微生物分解作用下，其过程具有缓慢分解和平稳供肥的特点，有利于提高肥料利用率和满足龙眼生长需要；反之，如下半年大量施用有机质肥，由于肥效长，易造成冬季营养生长过旺，叶色难于退绿，诱发冬梢，遇到不良的冬季条件下则难于成花，这在一些果园中已有深刻的体会和教训。同时，有机质肥只要能做到早施，就不必要堆沤，可提高肥效，方便施用。
龙眼的根外追肥作用迅速，保叶保果效果好。储良龙眼遇到不良天气如低温阴雨、寒潮、干旱或根际环境不良、挂果过多、抽穗或新梢抽生时易引起老叶脱落，应及时根外追肥。常用的是０·３％磷酸二氢钾、０·５％尿素，加核苷酸或农一清、生多素、绿宝、绿旺等各种专用的叶面肥。喷施时应先择阳光比较好的下午，注意主要喷在叶背多气孔的部位，一般每隔１０—１５天喷一次即可。
