微生態(tài)平衡是指在長期進(jìn)化過程中形成的正常微生物群與其宿主生態(tài)環(huán)境的生理性動態(tài)平衡，也就是說正常微生物群的組成是變化的，宿主的生態(tài)環(huán)境隨著年齡、生理狀態(tài)（如妊娠哺乳）等因素也發(fā)生變化，但是，當(dāng)這些因素相對穩(wěn)定時(shí)，正常微生物群的組成是穩(wěn)定的。而微生態(tài)失調(diào)是指在外界環(huán)境影響下，正常微生物群與宿主之間，各種群落成員之間的平衡，由生理性組合轉(zhuǎn)變?yōu)椴±硇越M合的狀態(tài)。從醫(yī)學(xué)微生態(tài)學(xué)的理論和實(shí)際出發(fā)，微生態(tài)失調(diào)可分為以下4類。
菌群失調(diào) 菌群失調(diào)是指在原生態(tài)環(huán)境內(nèi)正常微生物群發(fā)生種類、總菌數(shù)和各種群落成員的活菌數(shù)的異常變化。按其輕重程度分為：①Ⅰ度失調(diào)，只能從細(xì)菌的數(shù)量檢查上發(fā)現(xiàn)變化，在臨床上往往沒有表現(xiàn)或只有輕微反應(yīng)，不加治療，即可自然恢復(fù)；②Ⅱ度失調(diào)，是不可逆的，在臨床上多有慢性病的表現(xiàn)，例如慢性腸炎、慢性腎盂腎炎、慢性口腔炎或咽炎等；③Ⅲ度失調(diào)，表現(xiàn)為原來的正常菌群大部分被抑制，只有少數(shù)原來占劣勢的菌種演變?yōu)閮?yōu)勢菌，進(jìn)而引起疾病。例如葡萄球菌及艱難梭菌引起的偽膜性腸炎等，其他如變形桿菌、銅綠假單胞菌、白假絲酵母菌、肺炎克雷伯菌及大腸埃希菌等，都可引起Ⅲ度失調(diào)。Ⅲ度失調(diào)引起的疾病亦稱菌群交替癥或二重感染。
定位轉(zhuǎn)移 正常菌群由原定位的生態(tài)環(huán)境向周圍轉(zhuǎn)移，例如下消化道菌向上消化道的轉(zhuǎn)移。小腸污染綜合征就是明顯的下消化道菌向上轉(zhuǎn)移的一個(gè)例證。上呼吸道菌轉(zhuǎn)移到下呼吸道，下泌尿道菌轉(zhuǎn)移到腎盂，陰道菌轉(zhuǎn)移到子宮、輸卵管等，也是常見的定位轉(zhuǎn)移。許多正常菌群還可從表層向深層轉(zhuǎn)移，侵犯黏膜上皮細(xì)胞、淋巴組織和網(wǎng)狀內(nèi)皮系統(tǒng)。正常菌群寄居部位改變的異位寄生，也可引起疾病。
血行感染 血行感染可作為易位菌傳播的一種途徑，而血行感染本身又是一種易位感染。完全健康的人群中，有4%~10%的人有一過性菌血癥。正常菌群的定位轉(zhuǎn)移中，血行途徑具有重要意義，正常菌群進(jìn)入血行雖然常見，但在正常情況下并不形成感染，只有在身體衰弱免疫功能下降時(shí)才發(fā)生感染。
易位病灶 正常微生物群在遠(yuǎn)隔的臟器或組織形成病灶。這樣的病例多與膿毒敗血癥連續(xù)發(fā)生或同時(shí)發(fā)生有關(guān)。
引起微生態(tài)失調(diào)的誘發(fā)因素主要有以下幾個(gè)方面：
①射線照射：人或動物在接受一定量放射物質(zhì)與放射線照射后，吞噬細(xì)胞的功能與數(shù)量均下降，淋巴細(xì)胞功能減弱，血清的非特異殺菌作用減退或消失，免疫應(yīng)答能力明顯遭到破壞，此時(shí)易發(fā)生微生態(tài)失調(diào)。微生物對照射的抵抗力明顯大于其宿主，人或動物只要有數(shù)個(gè)Gy（戈瑞）就可產(chǎn)生病理作用，而細(xì)菌則需幾百個(gè)Gy才能損傷結(jié)構(gòu)，而且微生物在照射后對抗生素耐藥性提高，毒性亦增強(qiáng)。
②使用抗生素：抗生素使用可以引起菌群失調(diào)。Ⅰ度失調(diào)是可逆的；Ⅱ度失調(diào)是慢性失調(diào)，臨床表現(xiàn)為慢性炎癥，如慢性腎盂腎炎及慢性支氣管炎等；Ⅲ度失調(diào)是急性失調(diào)和菌群交替癥，臨床表現(xiàn)為急性炎癥，如白假絲酵母菌、銅綠假單胞菌等引起的局部炎癥和全身感染。在抗生素的選擇作用下，能增加正常微生物群對抗生素的耐藥性。在腸道正常菌群中，耐藥性傳遞是相當(dāng)頻繁的。如耐藥性葡萄球菌、銅綠假單胞菌等正常菌群常導(dǎo)致醫(yī)院內(nèi)感染。
�、弁饪剖中g(shù)：包括手術(shù)、整形、插管以及一切影響宿主生理解剖結(jié)構(gòu)的方法與措施，都有利于正常菌群的易位轉(zhuǎn)移，因此，在微生態(tài)失調(diào)的誘發(fā)因素中，外科治療措施占有重要位置。
④其他因素：包括醫(yī)源性因素、使用免疫抑制劑、細(xì)胞毒性物質(zhì)和激素等因素，都能使機(jī)體免疫功能下降，例如腸道正常菌群中的脆弱類桿菌和消化球菌等厭氧菌�？沙蔀闄C(jī)會致病菌而引起內(nèi)源性感染。