從生物化學(xué)觀點(diǎn)對(duì)生物群進(jìn)行比較研究的分支。在進(jìn)行比較時(shí),生物化學(xué)的適應(yīng)性雖是其中心概念,但對(duì)個(gè)體發(fā)生和生物進(jìn)化方面也是有用的。用作比較對(duì)象的有下列各方面:(1)代謝系統(tǒng)(例如,細(xì)菌的發(fā)酵類(lèi)型和進(jìn)化親緣關(guān)系及脊椎動(dòng)物氮的排泄。);(2)個(gè)別代謝產(chǎn)物(動(dòng)物的磷酸原、棘皮動(dòng)物特有的類(lèi)固醇化合物、植物的精油成分);(3)酶等蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)與功能、免疫學(xué)的相似性、物理化學(xué)的性質(zhì)(如呼吸色素,同工酶);(4)蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)及其排列順序;(5)遺傳因子DNA本身的比較。據(jù)認(rèn)為,上述第(4)項(xiàng)在討論系統(tǒng)發(fā)生時(shí)至為重要。對(duì)于細(xì)胞色素C、血紅蛋白、血纖維蛋白肽等方面的研究較多。分子中每個(gè)氨基酸被看成是獨(dú)立性狀,并開(kāi)始嘗試用統(tǒng)計(jì)方法來(lái)處理。與生理功能有關(guān)的方面,有水生生物和陸生生物、淡水生物和咸水生物及營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型等的比較研究。