與個體發(fā)生同為E．H．Haeckel（1886）提倡的術語。追尋生物的各種族從發(fā)生到絕滅的形態(tài)變化，簡而言之，就是種族的歷史。而phylogenie一詞也就是關于這方面的研究（系統(tǒng)學）。系統(tǒng)發(fā)生的研究，在現存生物的生物學中，是以比較解剖學、比較胚胎學和比較生物化學等作為基礎來進行的。在古生物學中是以追蹤各時代的生物遺跡，也就是化石來完成的。在19世紀的后半葉，根據生物發(fā)生律所追尋的系統(tǒng)發(fā)生是肯定可靠的，它也是促使比較胚胎學興盛的原因，但出現對此定律的種種批判，感到已達到了極限。但是進入本世紀后，由于貝爾（G．R．deBeer）及其他人對個體發(fā)生和系統(tǒng)發(fā)生的關系重新進行了研究而開辟了新的途徑。在古生物學的研究中，從W．H．Waagen（1869）對于菊石類（Ammo－nite）研究以來，直接探索系統(tǒng)發(fā)生，有不少成功的實例，如馬科、象科等的研究也包括在內。不過若從整個生物界來看，通過化石的研究來確定系統(tǒng)發(fā)生的情況還是不多的。
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