高M(jìn)OI( Multiplicity Of Infection,等于用于感染的病毒數(shù)目與細(xì)胞數(shù)目的比值)感染是生產(chǎn)蛋白的最好方法。這有兩個(gè)原因。一是不用考慮DIP(Defective Interfering Particles,即只包裝入部分基因組的病毒顆粒)的形成,因?yàn)殛P(guān)心的是細(xì)胞或者培養(yǎng)液中的蛋白;二是高M(jìn)OI感染是最便于控制、重復(fù)性好的方法,以達(dá)到高的蛋白表達(dá)水平。
低MOI感染也可用于生產(chǎn)蛋白,但是難以控制,難以達(dá)到最高的表達(dá)量。然而病毒需要量少的確是該法的一個(gè)優(yōu)點(diǎn),對(duì)于大規(guī)模的生產(chǎn)這個(gè)優(yōu)點(diǎn)極為有利,只要它們可以可靠的復(fù)制,這因不同的重組病毒而異。
一般說(shuō)來(lái),用高M(jìn)OI感染的方法就是將培養(yǎng)液中所有的細(xì)胞同時(shí)感染,每個(gè)細(xì)胞至少感染一個(gè)病毒顆粒。這個(gè)過(guò)程的幾率可以用Poisson分布來(lái)分析,簡(jiǎn)而言之,如果你想同時(shí)把所有的細(xì)胞都感染,MOI值應(yīng)該接近3。由于一旦加入病毒細(xì)胞就不再生長(zhǎng),因此你可以精確的控制感染時(shí)細(xì)胞的密度,這個(gè)密度大約應(yīng)該大約是平臺(tái)期最大密度的一半。隨著細(xì)胞株的不同,大約在1.5~2.5×106細(xì)胞/ml之間。
重要的是培養(yǎng)液的量要滿(mǎn)足細(xì)胞生長(zhǎng)的需要,否則將沒(méi)有足夠的營(yíng)養(yǎng)使細(xì)胞生產(chǎn)病毒或者蛋白。另一方面,病毒也不可以太多,以免在細(xì)胞增殖到合適密度并用掉所有營(yíng)養(yǎng)資源之前就被殺死。用高M(jìn)OI感染的方法,這些條件比較容易優(yōu)化,只需準(zhǔn)備密度變化在1~3×106細(xì)胞/ml之間的一系列細(xì)胞培養(yǎng)物,以固定的細(xì)胞:病毒比例去感染細(xì)胞,篩選蛋白產(chǎn)量最高時(shí)的那個(gè)密度即可。
采用這個(gè)方法需要你使用足夠量的病毒使細(xì)胞生長(zhǎng)立即停止。病毒量可以通過(guò)進(jìn)行一個(gè)小量實(shí)驗(yàn)來(lái)確定,先使細(xì)胞達(dá)到上面確定的最優(yōu)密度,然后變化病毒的量確定感染率。高M(jìn)OI感染的最大的缺點(diǎn)是需要準(zhǔn)備大量的高滴度病毒,這個(gè)缺點(diǎn)在大量生產(chǎn)時(shí)尤為突出。例如,如果你的病毒不能形成高滴度的溶液,只能達(dá)到3×107pfu/ml左右,你需要加相當(dāng)于細(xì)胞培養(yǎng)物20%體積的病毒。如果細(xì)胞的密度為2.5×106,體積為8升,那么為了得到密度為2×106細(xì)胞/ml的被感染細(xì)胞,需要加入2升病毒!你的細(xì)胞必須能夠生長(zhǎng)到較高的密度--2×106細(xì)胞/ml,并且保持對(duì)數(shù)期良好狀態(tài),你必須加入相當(dāng)于終體積20%的培養(yǎng)液以達(dá)到最終體積,這是實(shí)驗(yàn)?zāi)軌蝽樌M(jìn)行下去的極限。
然而,如果你可以得到高滴度的病毒以滿(mǎn)足感染的需要,這種方法的產(chǎn)量、可重復(fù)性非常高。因此,我建議在表達(dá)一個(gè)新的蛋白時(shí),開(kāi)始最好先試用這種方法。并且用這種方法得到的蛋白的產(chǎn)量可作為衡量其它方法(低MOI感染)產(chǎn)量的標(biāo)準(zhǔn)。尤其是當(dāng)你的培養(yǎng)物體積小時(shí)(小于500ml),這是最好的方法。
步驟
將你的細(xì)胞以2~8×105細(xì)胞/ml的密度分裝到搖瓶或者攪拌器中,達(dá)到搖瓶體積的20~40%,記得留出一些空間以待于將來(lái)加病毒。當(dāng)培養(yǎng)物的體積小于500ml時(shí),我更喜歡用搖瓶。在27±2℃培養(yǎng),轉(zhuǎn)速為100~130rpm。
第0天
培養(yǎng)細(xì)胞至密度達(dá)到大約1.5~2.5×106細(xì)胞/ml,即最大密度的一半。這可能需要多于1天的時(shí)間,與接種密度有關(guān)。
加入足夠的病毒,以使所有的細(xì)胞被同時(shí)感染,但是避免加入的病毒體積多于終體積20%,最好不要多于10%。加入的量取決于病毒的滴度。
如果細(xì)胞的密度為2×106細(xì)胞/ml,病毒的滴度為5×107pfu/ml,要達(dá)到MOI值為3,需要加入12%體積的病毒。
將搖瓶放回27℃搖床,培養(yǎng)24小時(shí)。
感染后第1天
計(jì)數(shù)細(xì)胞,估計(jì)細(xì)胞大小。如果是在高M(jìn)OI下感染,那么所有的細(xì)胞都已經(jīng)被感染。它們與第0天比將不會(huì)在數(shù)目上增長(zhǎng),并且在細(xì)胞形態(tài)上顯著膨脹。此時(shí)很容易看到細(xì)胞表面變得粗糙,這是病毒正在出芽的結(jié)果。
如果發(fā)現(xiàn)細(xì)胞數(shù)目有所增多,可能是由于對(duì)病毒滴度的估計(jì)偏高,使得細(xì)胞沒(méi)有全部被病毒感染。這種現(xiàn)象在MOI值大于3時(shí)很少出現(xiàn),因?yàn)橐话愕臈U病毒噬菌斑實(shí)驗(yàn)結(jié)果通常是低估病毒的滴度。如果細(xì)胞數(shù)目的增長(zhǎng)沒(méi)有超過(guò)25%,可能只會(huì)影響最佳收獲時(shí)間。平均每個(gè)細(xì)胞生產(chǎn)的蛋白量也會(huì)稍低。
感染后第2天
再次計(jì)數(shù)細(xì)胞,估計(jì)細(xì)胞大小。此時(shí)與第1天比細(xì)胞數(shù)目無(wú)論如何都不應(yīng)該再增長(zhǎng)。如果增長(zhǎng)了,你的感染可能分布不均勻,很可能是病毒滴度低造成的。
此時(shí)細(xì)胞應(yīng)該大大膨脹,細(xì)胞核占據(jù)了細(xì)胞的大部分空間。
此時(shí)可能是細(xì)胞或者培養(yǎng)液的時(shí)間了,這因不同的蛋白而異。大多數(shù)蛋白的產(chǎn)量在感染后48~72小時(shí)之間不會(huì)再有增長(zhǎng)。不過(guò)這需要實(shí)驗(yàn)來(lái)確定。
感染后第3天
再次計(jì)數(shù)細(xì)胞,估計(jì)細(xì)胞大小。此時(shí)所有的細(xì)胞應(yīng)該已經(jīng)被徹底感染,細(xì)胞膨脹并且生長(zhǎng)停止,否則就說(shuō)明沒(méi)有足夠的病毒使細(xì)胞在達(dá)到平臺(tái)期之前停止增長(zhǎng)。收獲培養(yǎng)物,離心分離細(xì)胞,將培養(yǎng)液避光保存于4℃,或者凍存于-70℃。
通常最好將細(xì)胞沉淀凍存。我喜歡的方法是將細(xì)胞重懸于小量(比如1/4體積)的PBS或者TBS(含有濃度為通常5倍的蛋白酶抑制劑)中,充分重懸后直接用微量移液器加入充滿(mǎn)液氮的干凈Dewar瓶中。滴下的重懸物遇到液氮迅速凍結(jié)形成小球,這些小球可以被分裝到50ml圓錐管中,凍存于Revco冰箱中。當(dāng)需要從細(xì)胞中純化蛋白時(shí),只需將這些小球逐個(gè)加入到3~5倍體積室溫下不斷攪拌的裂解緩沖液中,它們將很快融化,使緩沖液降至接近0℃。這些小球還可以用鑷子方便的轉(zhuǎn)移到eppendorf管中作小量實(shí)驗(yàn)。